南京市环境监测中心站，成立于1979年11月，隶属南京市环境保护局，是财政全额拨款的社会公益性事业单位，是全市环境监测系统的网络中心、技术中心、信息中心和培训中心。全站编制121，在岗121人；监测用房5800平方米，仪器设备800余台套；目前，通过中国实验室认可的监测能力7大类、279个方法、637个参数，是国家试验室认可的协作定值实验室，具有环境标志产品检验、无公害农产品认定检测和室内环境检测资质。

　　按国家规范，根据省、市要求，对全市空气、地表水、地下水、声环境、辐射环境，采用人工和自动在线监测方式，实施例行环境质量评价和污染状况调查监测；对重点污染企业进行监督监测；对污染事故进行应急监测；还承担污染源评价、污染处理设施验收、环境本底调查及污染纠纷与仲裁监测。

　　环境空气以自动监测为主，覆盖全市，共16个自动监测点、其中9个国控点，手工监测共54个点。地表水监测以人工采样为主，对115个功能区共布设282个监测点，基本覆盖了所有河流湖泊和水源地，另在长江苏皖省界、夹江饮用水源地、固城湖等重点水质断面布设5个自动监测点。声环境和辐射环境为人工监测，对主城区330个网格、227个路段实施噪声监测；对全市1600多枚放射源、1170多台射线装置、城区280平方公里的地表伽马辐射剂量率和电磁辐射实施监督和管理监测。此外，还承担了污染处理设施验收、环评、环境专项调查监测每年400余家（次）。

　　对污染企业的监测范围主要为全市85%以上污染负荷的重点企业，人工监测共66家，158个废气排口和120个废水排口。污染源在线自动监测已覆盖183家企业，对153个废气排口，190个废水排口进行了自动监测。

      南京市环境监测中心站，自1988年获得市级文明单位称号以来，已连续11次获得市文明单位、连续6次获得省文明单位（标兵）称号，2008年被全国妇联授予“全国三八红旗集体”荣誉称号，2011年获“‘十一五’全国环保系统先进集体”荣誉称号，还多次荣获“建设新南京先进单位”、“江苏省模范职工之家”等近200项荣誉。